微生物基因组重测序
全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序，并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。重测序能够检测全基因组的罕见变异，可获得大量的单核苷酸多态性（SNP）信息、序列的插入缺失位点信息。
全基因组测序
全基因组测序WGS（Whole Genome Sequencing）是使用高通量测序平台对一种生物样本的基因组中的全部基因和非基因序列进行测序，测定其DNA 的碱基序列。
宏基因组测序（第二代高通量测序 微生物基因功能分析）
宏基因组测序对特定生境样品中微生物群体基因组进行序列测定，进而分析微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体多样性与丰度，探求微生物与环境，微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。
宏基因组de novo测序
宏基因组学也称为元基因组学，是以样品中的微生物群落作为整体进行研究的学科，以功能基因筛选和测序分析为研究手段，能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及环境之间的关系。